头颈外科是以手术治疗口腔颌面部、耳鼻咽喉部、颈部及颅底恶性肿瘤为主的科室。1958年我院建院，头颈外科是国内肿瘤学界最早建立的科室之一。在哈献文、屠规益、李庆宏、唐平章、徐震纲、刘绍严等历任学科带头人的带领下，经过几代头颈医师的努力，科室逐渐发展壮大。现科室设有三个病区，病床100张，共有医护人员80名（医生33名，护士47名），其中主任医师10人，副主任医师4人。2019年，我科接诊门诊病人超过7.3万人次，完成手术6300余台。目前，头颈外科是临床肿瘤学国家重点学科点之一，是中国协和医科大学硕士、博士学位授权点之一，目前有博士生导师4人、硕士生导师4人。
我科在国内最早开展喉及下咽部分切除手术、颅底手术、鼻咽癌放疗失败后挽救手术及下咽颈段食管癌的术前放疗综合治疗等，提高了生存率。另一方面，强调肿瘤外科的器官功能保全性治疗，应用各种游离皮瓣修复头颈部术后缺损，以提高患者生存质量。坚持定期对喉全切除的患者组织食管发音训练，使患者能够恢复语言能力，在国内居领先水平。此外，我科与神经外科密切合作治疗各种颅底肿瘤，特别是颅底沟通肿瘤颇具特色。