该教研室由临床病理科和检验科组成。病理科是国家临床重点专科、国家卫生健康委员会肺癌、食管癌、结直肠癌、乳腺癌等病理诊断规范主编单位。2017年获中国合格评定国家认可委员会（CNAS）医学实验室（ISO15189）认可，是目前国内获认可的人数及能力范围最多的病理科。病理科常规业务由组织病理、细胞病理、分子病理、病理技术四部分构成，总面积约占4000余平米，现有在职职工106人，包括主任医师11人，副主任医师6人；副研究员及助理研究员7人，博士学位38人，硕士学位23人。病理科共设13个亚专科，学科设置齐全，形成了针对全身各系统及部位肿瘤的病理诊断优势，建立了完善的病理诊断质量控制和质量保证体系。1997年成为协和医学院博士研究生培养点，现有博士研究生导师2名，硕士研究生导师13名，并开设了北京协和医学院《肿瘤病理学》研究生课程。病理科于2007年被评定为北京首批住院医师规范化培训基地，2021年评为首批国家重点临床病理学规培基地。2021年基地在培规培生24名。每年接受进修医师培训10-20名，设有高级进修医师研修班，实现量身定制，培养病理高水平人才。病理基地具有丰富的教学资源，整合病理科资源编写有《病理基地住院医师岗前培训》、《临床病理基本技能规范》和《术中冰冻病理诊断及解析》等书籍。近5年承担科技部国家重点研发计划1项，国家自然科学基金面上项目7项，国家自然科学基金青年项目共12项，省部级项目、其他院校项目10项，承担教学课题8项，发表国际国内期刊论文200余篇，单篇最高影响因子33分。病理科牵头编写10部国际和国内专家共识和指南，主编出版8部专著及合作出版10部专著。

检验科由临床基础检验（含骨髓细胞学）、临床生物化学、临床免疫学、临床细胞分子遗传学和临床微生物学5个专业组构成。现有正高级职称2人，副高级职称5人，获得博士学位16人，获得硕士学位7人。检验科是全国最早依托于肿瘤临床诊断、治疗而建立的检验专业科室，以肿瘤实验室诊断及研究为目标，开展检验项目400余项，积累了大量的肿瘤检验案例，其中以肿瘤相关标志物的实验室检测为特色，达到国际先进水平。检验科是北京协和医学院临床检验诊断学专业的博士点、硕士点，已培养博士及硕士研究生20余人，现有博士生导师1名，在读研究生11名。同时，也是首批国家级及北京市检验医师（技师）规范化培训基地，获得师资认证的带教老师24名，已结业人员40余人，在培住院医（技）师8人。近5年，培养来自全国各地进修生30余人次。近5年，检验科承担国家自然科学基金、国家重点研发项目、北京市自然科学基金、医科院创新基金等课题30余项，发表论文200余篇；承担教学课题8项，发表教学文章6篇。