中国医学科学院肿瘤医院于2001年获批成为首批国家级继续医学教育基地，依托医院肿瘤诊治、教学、科研、预防优势，发挥知名肿瘤防治专家团队作用，通过开展独具特色的培训项目来推广肿瘤诊断治疗、预防控制、早诊早治等新理论、新知识、新技术，注重理论联系实践，培训内容覆盖了肿瘤学各专业方向。从2010年到2021年，共举办国家级继续教育项目352项，培训154805人次。培训人群辐射全国各省市，为全国培养师资、学术带头人和专业技术骨干，促进了先进技术的普及和应用，推动了全国肿瘤规范化诊治水平的提升。

同时，为加强本院医技人员和护理人员自身发展，肿瘤医院也开展北京市区级继续医学教育项目以及院级的继续医学教育项目，并于2019年打造了继续医学教育学习平台，医护人员可以通过网络平台，利用碎片化时间开展继续医学教育培训，促进自身职业发展。